Na pripravah svoje izbrane vrste je imel Aragones rasistični izpad v zvezi s francoskim napadalcem Arsenala Thierryjem Henryjem. Omenjeni nogometni strokovnjak je namreč med treningom stopil k svojemu napadalcu Joseju Antoniu Reyesu, ki prav tako igra za londonsko moštvo, in mu zavpil: "Povej temu črnemu drekaču, da si boljši od njega. Ti si najboljši. Povej mu, da mu jaz to sporočam!"
Aragones je pozneje na novinarski konferenci skušal zmanjšati pomen incidenta, saj je trdil, da je šlo le za šalo. "Jaz sem državljan sveta, nekateri moji najboljši prijatelji pa so prav tako temnopolti in to že iz otroštva. To je bila le šala, s katero sem želel motivirati Reyesa. To nima nikakršne zveze z rasizmom, ker jaz nisem rasist," je zatrdil 66-letni španski trener, njegove besede pa je potrdil tudi nogometaš.