V arzenalu Sove bo poleg različnih vrst pištol in revolverjev tudi dolgocevno in avtomatsko orožje. Nošenje orožja odredi direktor agencije pri nalogah varovanja prenosov pošiljk strogo zaupnih podatkov, varovanja direktorjev in gostov agencije in drugih izpostavljenih oseb ter za odvrnitev neposrednega napada na tajne agente.
Preden uradna oseba agencije uporabi strelno orožje, mora po šestem členu uredbe, kadar okoliščine to dopuščajo, osebo opozoriti s klicem "stoj streljal bom!" in z opozorilnim strelom. Zakon o Sovi, sprejet leta 1999, za tajne agente ni predvidel možnosti nošenja orožja.
Med razloge za sprejem nove uredbe direktor agencije Tomaž Lovrenčič omenja tudi selitev Sove v novo poslovno zgradbo na Stegne v Ljubljani, saj bo Sova sama skrbela za varovanje objekta. Sedež Sove se sedaj nahaja v poslopju ministrstva za notranje zadeve, ki je po besedah Lovrenčiča povsem neprimerno za občutljivo delo tajne službe.