Kot je sporočila filipinska policija, je do obeh eksplozij prišlo v razmaku nekaj minut. V trgovski četrti je prebivalce zajela panika, reševalci, ki so na kraj eksplozije prišli pol ure kasneje so poizkušali poskrbeti za ranjence. V eni od veleblagovnic naj bi našli še eno bombo, ki pa je eksplodirala potem, ko so jo že odnesli izven zgradbe. Iz strahu pred morebitnimi nadaljnjimi napadi so kmalu zatem številni trgovci v Zamboangi zaprli svoje trgovine.
Filipinske oblasti za napad sumijo skrajno islamsko skupino Abu Sajaf, bolj znano po ugrabitvah zahodnih turistov. Voditelj Abu Sajafa je napovedal oborožen boj proti kristjanom kot nevernikom, ki ogrožajo islam v tem delu Azije in javno priznal, da sodeluje s teroristično mrežo Al Kaida. Abu Sajaf naj bi bil odgovoren tudi za bombni napad v istem mestu pred 14 dnevi, ko so bili ubiti trije Filipinci in ameriški vojak. Ozadje dogodka zaenkrat še ni znano, prav tako še nihče ni prevzel odgovornosti.
V tem mestu je sicer že v začetku oktobra prišlo do bombnega napada na nek lokal, pri čemer je bil ubit ameriški vojak in trije Filipinci. Oblasti so za napad obdolžile skrajno islamsko gibanje Abu Sajaf, ki naj bi sodelovalo s teroristično mrežo Al Kaida.