V zvezi z vprašanjem vojne odškodnine, ki predstavlja eno od odprtih vprašanj med Hrvaško in ZRJ, je še dejal, da so načini in roki izplačil zdaj vprašanje meddržavnih sporazumov.
"Če so prostovoljci, zbrani v Srbiji, skupaj z jugoslovansko vojsko napadali in uničevali hrvaška mesta ter ubijali hrvaške državljane, potem Srbija ne more trditi, da ni vedela za to," je dejal Mesić. Po njegovem mnenju je nekdanji jugoslovanski predsednik Slobodan Milošević izzval vojno na Hrvaškem, da bi se tako vojna razširila še v BiH, kjer je hotel "vzeti maksimum". Pri tem je še menil, da je tudi BiH bila "žrtev srbske agresije, vendar pa z elementi državljanske vojne".
V zvezi s prostovoljno predajo nekdanjega srbskega predsednika Milana Milutinovića haaškemu Mednarodnemu sodišču za vojne zločine na območju nekdanje Jugoslavije pa je hrvaški predsednik dejal, da je ta "povsem razumljiva". Kot je povedal Mesić, je povsem razumljivo, da se Milutinović pojavi pred haaškim sodiščem, ker so se zločini na Kosovu zgodili v času, ko je bil on predsednik države, ki je te zločine izvajala. Po Mesićevih ocenah mora haaško sodišče zdaj presoditi, v kolikšni meri, če sploh, je to Milutinovićeva krivda.
