Čeprav v Vatikanu ne govorijo javno o spolnih zlorabah otrok, ki jih zagrešijo duhovniki, se tega problema zavedajo. Zato je kardinal Joseph Ratzinger, vodja kongregacije za doktrino vere, ki je najvišja moralna avtoriteta rimskokatoliške cerkve, pozval škofe naj v primerih pedofilije med svojimi duhovniki obvestijo kongregacijo. Ta se bo odločila, ali naj o tem obvesti lokalne oblasti ali naj proti grešniku sproži svojo, cerkveno preiskavo.
Cerkvena sodišča so namenjena urejanju internih cerkvenih zahtev. Obravnavajo zadeve, ki se nanašajo na cerkveno disciplino. Duhovnik, ki krši cerkveni red, se tako lahko znajde pred cerkvenim sodiščem.