Pravosodni minister Lovro Šturm je v oceni stanja na ministrstvu ugotovil, da je sistem notranje kontrole pri poslovanju neučinkovit in neustrezen predvsem pri oddaji javnih naročil in na področju varovanja premoženja. Pri notranjih in zunanjih revizijah so tako ugotovili večje kršitve zakona o javnih naročilih in zakona o javnih financah.
Posebej so na ministrstvu poudarili nepravilnosti pri oddaji javnega naročila za najem službenega avtomobila ter pri projektu informatizacije vzpostavitve centralne kazenske evidence. Slednji še ni zaključen, saj je bila pred iztekom mandata prejšnje vlade podpisana pogodba v breme proračuna za leto 2005-2007, v višini pogodbene vrednosti prek 180 miljonov SIT. Zaradi suma večjih nepravilnosti je minister Šturm že odredil interno revizijo skladnosti pogodbe z veljavno zakonodajo.
Evidence se ne ujemajo z knjigovodskim stanjem premoženja

Neurejeno je tudi stanje na področju vodenja evidenc stvarnega in finančnega premoženja, posebej na področju nepremičnin, poudarjajo na ministrstvu. Evidence namreč ne zagotavljajo verodostojnosti izkazanega knjigovodskega stanja premoženja ministrstva.
Zaradi vse teh ugotovitev so na ministrstvu v začetku letošnjega leta 2005 na novo pristopili k vzpostavitvi ustreznega in učinkovitega sistema notranjega nadzora, da bi tako zagotovili zakonitost in gospodarnost poslovanja.
Prostorske težave
Prav tako se ministrstvo za pravosodje spopada s prostorskimi težavami. Prostori ministrstva na Župančičevi 3 v Ljubljani so prezasedeni, saj v posameznih pisarnah delajo tudi po štirje delavci, ugotavlja minister.
Del oddelkov imajo tudi v najetih prostorih na Dalmatinovi 2, vendar predvidevajo, da bodo najemno pogodbo še letos prekinili in delavce v manjše in cenejše najete prostore na Beethovnovi 2.
Rešitev prostorskih težav pa ministrstvo vidi v pridobitvi prostorov na Župančičevi 6, ki jih bo predvidoma v letu 2006 izpraznilo Ministrstvo za šolstvo in šport.
Opozarjajo pa tudi, da bo v okviru obstoječih kapacitet v lasti države, potrebno zagotoviti prostore tudi za Center za izobraževanje v pravosodju.