Blaškića so spoznali za krivega v vseh 20 obtožnicah, kolikor jih je bilo podano proti njemu, med drugim zaradi kršenja ženevske konvencije ter zločinov proti človeštvu. V procesu, ki je trajal kar 25 mesecev, je nastopilo 158 prič, sodišču pa so predložili približno 3000 strani dokazov.
Blaškić je bil v času vojne v BiH poveljnik vojaških sil bosanskih Hrvatov, sodeloval pa je tudi v napadu na dolino Lasva, ko so vojaki, potem ko so požgali vas Ahmići, ubili več kot 100 vaščanov. Čeprav Blaškić pri pobojih ni sodeloval, pa je bil obtožen, ker zločinov ni skušal preprečiti.