Linux potencialno krši kar 283 patentov. Med njimi pa je tudi 27 patentov v lasti Microsofta. To so z večmesečno analizo jedra ugotovili pri podjetju Open Source Risk Management, ki jo je izvedel Dan Ravicher, ustanovitelj organizacije Public Patent Foundation.
Čeprav sporni patenti na sodišču še niso bili potrjeni, vseeno predstavljajo veliko potencialno breme za uporabnike Linux. Četudi bi ti na sodišču uspešno dokazali neveljavnost patenta, je to mnogokrat povezano z velikimi stroški, ki v ZDA v povprečju dosežejo okrog 3 milijone ameriških zelencev.