Inštitut je bil za raziskovanje manjšinskih vprašanj ustanovljen 1. februarja 1925 na pobudo Vinka Zormana. Takrat zasebni inštitut se je ukvarjal z vprašanji Slovencev v Italiji, Avstriji in na Madžarskem, ki so po prvi svetovni vojni v veliki meri ostali zunaj meja medvojne Kraljevine SHS, deloma pa so že takrat preučevali položaj italijanske in madžarske manjšine v Sloveniji. Poleg ukvarjanja z dokumentacijsko, raziskovalno-analitično ter publicistično dejavnostjo je že od začetka beležil tudi mednarodne uspehe, saj so strokovno podporo med drugim nudili tudi Kongresu evropskih manjšin, takratni osrednji evropski manjšinski organizaciji, ki jo je od leta 1925 do druge svetovne vojne vodil tržaški Slovenec Josip Vilfan.
Financiranje inštituta je leta 1930 prevzela takratna Banska uprava. Leta 1941, z začetkom vojne, so morali del gradiva v strahu pred okupatorji uničiti, ostanek gradiva pa je vojno srečno preživel dobro skrit v Narodni in univerzitetni knjižnici. Še pred koncem vojne, leta 1944, je bilo delo inštituta z ustanovitvijo Partizanskega znanstvenega inštituta v Rogu obnovljeno z istimi ljudmi in dokumentacijo, s katero je po koncu vojne veliko prispeval tudi k pravičnejši določitvi slovenske povojne meje.
Po koncu mirovnih pogajanj je dobil inštitut sedanje ime, svoje področje raziskovanja pa je razširil tudi na mednacionalne odnose, mednarodno zaščito manjšin in varstvo človekovih pravic. Inštitut predstavlja osrednjo interdisciplinarno znanstveno raziskovalno institucijo za raziskovanje narodnostnih in še posebej manjšinskih vprašanj v Sloveniji, je še povedal Stergar.
Čeprav je bila 75-letnica že spomladi, je bila proslava tudi zaradi finančnih težav, ki jih ima inštitut, šele sedaj. Zakonska in proračunska neurejenost financiranja je namreč še posebej neugodna za majhne družboslovne raziskovalne ustanove, ki nimajo možnosti nastopanja na trgu. Tako se je zgodilo, da so na začetku letošnjega leta ostali celo brez plač. Kljub težavam se pripravljajo na ustanovitev Evropskega centra za etnične študije, ki se bo v okviru partnerstva za mir ukvarjal s preprečevanjem medetičnih konfliktov, je za povedal strokovni svetnik INV Janez Stergar.
