Obstoj netopirjev ogrožata predvsem intenzivno kmetijstvo in uničevanje gozdnih površin, saj zaradi tega prihaja do zmanjševanja števila razpoložljivih ustreznih zatočišč in območij za prehranjevanje.
Na območju Italije živi 35 vrst netopirjev, pri čemer jih je po kategorizaciji Svetovne zveze za ohranitev narave in naravnih virov IUCN (The World Conservation Union) osem v nevarnosti oziroma ranljivih, šest v nizki nevarnosti, vendar blizu tega, da postanejo ranljive, 16 pa v nizki nevarnosti za izumrtje. Pri petih vrstah za oceno ogroženosti ni dovolj podatkov.
Občutljivi netopirji
Po mnenju strokovnjakov, ki so za italijansko okoljsko ministrstvo in italijanski inštitut za divjo favno pripravili smernice za monitoring netopirjev oziroma za njihovo proučevanje in ohranitev, so netopirji zelo občutljivi na hitre okoljske spremembe.
Njihov obstoj, kot že omenjeno, je ogrožen zlasti zaradi uničevanja primernih naravnih mest za zimsko spanje, reprodukcijo in dnevno spanje ter zaradi uničevanja območij, kjer se netopirji prehranjujejo. Medtem ko slednjemu botrujeta predvsem zmanjševanje gozdnatih površin in intenzivno kmetijstvo, gre pri prvem vzroku ogroženosti za nestrokovno prenavljanje starih zgradb, zapiranje vhodov v jame ali zapuščene rudnike in motenje netopirjev med spanjem.
